截止2007年，大學(xué)主體由7個(gè)系，1個(gè)學(xué)院和1個(gè)研究所組成：
科學(xué)系（lafacultédessciences）
醫(yī)學(xué)系（lafacultédemédecine）
文學(xué)系（lafacultédeslettres）
經(jīng)濟(jì)與社會(huì)科學(xué)系（lafacultédesscienceséconomiquesetsociales）
法學(xué)系（lafacultédedroit）
神學(xué)系（lafacultédethéologie）
心理學(xué)和教育學(xué)系（lafacultédepsychologieetdessciencesdel'éducation）
翻譯學(xué)院（Écoledetraductionetd'interprétation）
建筑學(xué)研究所（Institutd'architecture）
大學(xué)的從屬學(xué)院還包括八個(gè)系屬學(xué)校和跨系別研究中心：
法語文化及語言學(xué)校（Écoledelangueetdecivilisationfrançaises）（文學(xué)系下屬）
體育教育學(xué)校（Écoled'éducationphysiqueetdesport）（醫(yī)學(xué)系下屬）
大學(xué)信息中心（Centreuniversitaireinformatique）
大學(xué)人口生態(tài)學(xué)及環(huán)境科學(xué)中心（Centreuniversitaired'écologiehumaineetdessciencesdel'environnement）
大學(xué)能源問題研究中心（Centreuniversitaired'étudedesproblèmesdel'énergie）
老年問題中心（Centreinterfacultairedegérontologie）
宗教改革史研究所（Institutd'histoiredelaréformation）
日內(nèi)瓦大學(xué)歐洲中心（Instituteuropéendel'universitédeGenève）
以下獨(dú)立學(xué)院也依托于日內(nèi)瓦大學(xué)：
高級(jí)國際關(guān)系及發(fā)展學(xué)院（Institutdehautesétudesinternationalesetdudéveloppement），2008年由原國際高等教育學(xué)院（Institutdehautesétudesinternationales）和國際發(fā)展學(xué)院（Institutuniversitaired’étudesdudéveloppement）合并而成
Bossey神學(xué)院（Institut?cuméniquedeBossey）
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